Joan Enric Lluna compagina la seva tasca com clarinetista amb la direcció d’orquestra. En la seva faceta de director i solista-director, Lluna s’ha posat al capdavant d’orquestres com la Luzerne Festival Strings, Manchester Camerata, la OCV del Palau de les Arts, la Covent Garden Chamber Orchestra, la Kensington Chamber Orchestra de Londres, l’Orquestra de València, la Real Filharmona de Galícia o l’O. Filharmònica de Màlaga. És el primer clarinet de l’Orquestra de la CV, conjunt titular del Palau de les Arts Reina Sofia, i de l’Orquestra de Cadaqués, de la qual és cofundador. Com a primer clarinet convidat, ha actuat amb formacions entre les quals s’inclouen la London Philarmonic i la Royal Philharmonic Orchestra, la Academy of St. Martin in the Fields i la Chamber Orchestra of Europe. Lluna és l’impulsor i director del grup de cambra Moonwinds, integrat per instruments de vent i que reuneix intèrprets de primer nivell. A més, des de l’any 2009 dirigeix el Festival Internacional «Residències de Música de Cambra» de Godella, València.